Ubicado en el antecoro bajo la iglesia se encuentra el centro museístico TESOROS ESPIRITUALES DE LA REINA SANTA ISABEL.

En este lugar se encuentra una exposición con reliquias y diversos objetos de la colección de la Cofradía entre ellos mechones de cabello de la Reina el bastón de peregrino que le fue ofrecido por el Arzobispo de Santiago de Compostela durante su peregrinación tras la muerte de Don Dinis las vestiduras con que fue amortajada la Reina Santa Isabel mandadas reponer por la Reina María Segunda cuando visitó el Monasterio por no considerarlas las más dignas así como un cofre relicario que contiene estos mismos sudarios bordados junto con una sábana.

En este lugar también se encuentran colecciones procedentes de varios países como ornamentos litúrgicos misales y crucifijos realizados en nácar y pólvora negra del siglo XVII.

 En esta sala también podemos ver varias esculturas como las de San Bartolomé San Francisco y San Miguel Arcángel.