Situé dans l'antéchoeur sous l'église se trouve le centre muséal TRÉSORS SPIRITUELS DE LA REINE SANTA ISABEL

Dans cet endroit se trouve une exposition avec des reliques et divers objets de la collection de la Confrérie parmi lesquels des mèches de cheveux de la Reine le bâton de pèlerin qui lui fut offert par l'archevêque de Saint-Jacques-de-Compostelle lors de son pèlerinage après la mort de Don Dinis les vêtements dans lesquels la reine Sainte Isabelle était enveloppée ordonnés d'être remplacés par la reine Marie DEUXIÈME lorsqu'elle visita le monastère car elle pensait qu'ils n'étaient pas les plus dignes ainsi qu'une boîte reliquaire qui contient ces mêmes linceuls brodés ainsi qu'un drap

On trouve également dans ce lieu des collections provenant de plusieurs pays comme des vêtements liturgiques des missels et des crucifix en nacre et poudre noire du XVIIe siècle

Dans cette salle nous pouvons également voir plusieurs sculptures telles que celles de Saint Barthélemy de Saint François et de Saint Michel Archange